Pracownia Spektrometrii Mas
Zakup aparatury LC-MS został sfinansowany z Funduszu Aparatury Badawczej programu „Inicjatywa Doskonałości — Uczelnia Badawcza” realizowanego na Uniwersytecie Wrocławskim.
Pracownia prowadzi kompleksowe analizy naukowe z zakresu spektrometrii mas białek oraz proteomiki na potrzeby projektów badawczych realizowanych na Wydziale Biotechnologii. Możliwa jest także współpraca naukowa z podmiotami spoza Wydziału.
Zapytania o analizy oraz konsultacje: michal.tracz2@uwr.edu.pl
Prowadzący:
dr Michał Tracz 
Opiekun naukowy:
prof. dr hab. Artur Krężel
Aparatura
Zakres analiz
Analizy białkowe
- pomiar masy białka lub peptydu (RP-LC)
- analiza modyfikacji lub PTM oczyszczonego białka (fragmentacja CID albo ETD)
- oznaczenia ilościowe białek/peptydów z matryc biologicznych metodą celowaną (ToF-MRM)
- analizy strukturalne białka lub peptydu metodą wymiany proton-deuter (HDX)
- MS w warunkach niedenaturujących (Native MS)
Proteomika
- identyfikacja białek z matryc biologicznych, żelów PAGE (w tym SDS-PAGE) oraz po CoIP
- szacowanie ilościowe białek z matryc biologicznych, żelów PAGE (w tym SDS-PAGE) oraz po CoIP (eksperymenty typu Shot-gun proteomics, BioID etc.)
- analiza białek zmodyfikowanych potranslacyjnie z matryc biologicznych (acetyloproteomika, ubikwitynoproteomika, fosfoproteomika etc.)
Analizy niebiałkowe
- pomiar masy związku + profil izotopowy (RP-LC)
- pomiar widma MS/MS związku (fragmentacja CID)
- oznaczenia ilościowe związków z matryc biologicznych metodą celowaną (ToF-MRM)
Publikacje z udziałem Pracowni Spektrometrii Mas Białek
- Markowska, K., Litwin, I., Kończak, J., Misiorna, D., Broczkowska, A., Tomaszewska, P., Tracz, M., Haenen, M. & Kramarz, K. (2025). PolySUMOylation of PCNA and Rad52 restricts centromeric recombination in fission yeast. Nature Communications, https://doi.org/10.1038/s41467-025-65862-1
- Pomorski, A., Wu, S., Tracz, M., Orzeł, A., Bezdekova, J., Brambor, A., … Krężel, A. (2025). Biarsenical-based fluorescent labeling of metallothioneins as a method for ultrasensitive quantification of poly-Cys targets. Analytica Chimica Acta, https://doi.org/10.1016/j.aca.2024.343550
- Śmiga, M., Roszkiewicz, E., Ślęzak, P., Tracz, M., & Olczak, T. (2025). cAMP-independent Crp homolog adds to the multi-layer regulatory network in Porphyromonas gingivalis. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, https://doi.org/10.3389/fcimb.2025.1535009
- Mosna, K., Orzeł, A., Tracz, M., Wu, S., & Krężel, A. (2025). Modification of human metallothioneins by garlic organosulfur compounds, allicin and ajoene: direct effect on zinc homeostasis with relevance to immune regulation. BioMetals, https://doi.org/10.1007/s10534-025-00716-3
- Wolański, M., Płachetka, M., Naumouskaya, V., Strzałka, A., Tracz, M., Valietova, D., & Zakrzewska-Czerwińska, J. (2025). AdpA, a Global Regulator of Hundreds of Genes, Including Those for Secondary Metabolism, in Streptomyces venezuelae. Antibiotics, https://doi.org/10.3390/antibiotics14090878
- Hryniewicz-Jankowska, A., Tracz, M., Opiełka, I., Augoff, K., Czogalla, A., & Sikorski, A. F. (2025). Quantitative proteomic data of flotillin-2 interactome within detergent resistant membranes of HeLa cells. Data in Brief, https://doi.org/10.1016/j.dib.2025.111970.
- Peris-Díaz, M.D., Krężel, A. & Barran.P. (2025). Deciphering the safeguarding role of cysteine residues in p53 against H2O2-induced oxidation using high-resolution native mass spectrometry. Commun Chem. https://doi.org/10.1038/s42004-024-01395-w
- Ciura, K., Sobota, O., Chorążewska, A. et al. (2025). Reprogramming FGF1 from the natural growth factor to the engineered heparan sulphate biosensor. Cell Commun Signal, https://doi.org/10.1186/s12964-025-02269-x
- Porębska, N., Chorążewska, A., Ciura, K., Pomorski, A., Krężel, A., & Opaliński, Ł. (2025). Innately Fluorescent Tetravalent Cytotoxic Conjugate TetraFHER2-vcMMAE Engages Aggregation-Dependent Endocytosis of HER2 for Enhanced Intracellular Drug Delivery. Journal of Medicinal Chemistry, https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.5c00782.
- Duława-Kobeluszczyk, J., Strzałka, A., Tracz, M., Bartyńska, M., Pawlikiewicz, K., Łebkowski, T., … Others. (2024). The activity of CobB1 protein deacetylase contributes to nucleoid compaction in Streptomyces venezuelae spores by increasing HupS affinity for DNA. Nucleic Acids Research, https://doi.org/10.1093/nar/gkae418
- Kalka, M., Chorążewska, A., Gędaj, A., Żukowska, D., Ciura, K., Biaduń, M., … Opaliński, Ł. (2024). Engineered intrinsically fluorescent galectin-8 variants with altered valency, ligand recognition and biological activity. International Journal of Biological Macromolecules. https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2024.134371
- Peris-Díaz, M. D., Orzeł, A., Wu, S., Mosna, K., Barran, P. E., & Krężel, A. (2024). Combining Native Mass Spectrometry and Proteomics to Differentiate and Map the Metalloform Landscape in Metallothioneins. Journal of Proteome Research. https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.4c00271
- Śmiga, M., Ślęzak, P., Tracz, M., Cierpisz, P., Wagner, M., & Olczak, T. (2024). Defining the role of Hmu and Hus systems in Porphyromonas gingivalis heme and iron homeostasis and virulence. Scientific Reports, https://doi.org/10.1038/s41598-024-82326-6
