Pracownia Spektrometrii Mas
Zakup aparatury LC-MS został sfinansowany z Funduszu Aparatury Badawczej programu „Inicjatywa Doskonałości — Uczelnia Badawcza” realizowanego na Uniwersytecie Wrocławskim.
Pracownia prowadzi kompleksowe analizy naukowe z zakresu spektrometrii mas białek oraz proteomiki na potrzeby projektów badawczych realizowanych na Wydziale Biotechnologii. Możliwa jest także współpraca naukowa z podmiotami spoza Wydziału.
Zapytania o analizy oraz konsultacje: michal.tracz2@uwr.edu.pl
Prowadzący:
dr Michał Tracz 
Opiekun naukowy:
prof. dr hab. Artur Krężel
Aparatura
Zakres analiz
Analizy białkowe
- pomiar masy białka lub peptydu (RP-LC)
- analiza modyfikacji lub PTM oczyszczonego białka (fragmentacja CID albo ETD)
- oznaczenia ilościowe białek/peptydów z matryc biologicznych metodą celowaną (ToF-MRM)
- analizy strukturalne białka lub peptydu metodą wymiany proton-deuter (HDX)
- MS w warunkach niedenaturujących (Native MS)
Proteomika
- identyfikacja białek z matryc biologicznych, żelów PAGE (w tym SDS-PAGE) oraz po CoIP
- szacowanie ilościowe białek z matryc biologicznych, żelów PAGE (w tym SDS-PAGE) oraz po CoIP (eksperymenty typu Shot-gun proteomics, BioID etc.)
- analiza białek zmodyfikowanych potranslacyjnie z matryc biologicznych (acetyloproteomika, ubikwitynoproteomika, fosfoproteomika etc.)
Analizy niebiałkowe
- pomiar masy związku + profil izotopowy (RP-LC)
- pomiar widma MS/MS związku (fragmentacja CID)
- oznaczenia ilościowe związków z matryc biologicznych metodą celowaną (ToF-MRM)
Dorobek naukowy
Publikacje z udziałem Pracowni Spektrometrii Mas Białek:
-
Biarsenical-based fluorescent labeling of metallothioneins as a method for ultrasensitive quantification of poly-Cys targets (2025)
-
Deciphering the safeguarding role of cysteine residues in p53 against H2O2-induced oxidation using high-resolution native mass spectrometry (2025)
-
Combining Native Mass Spectrometry and Proteomics to Differentiate and Map the Metalloform Landscape in Metallothioneins (2024)
-
Defining the role of Hmu and Hus systems in Porphyromonas gingivalis heme and iron homeostasis and virulence (2024)
-
Engineered intrinsically fluorescent galectin-8 variants with altered valency, ligand recognition and biological activity (2024)
-
The activity of CobB1 protein deacetylase contributes to nucleoid compaction in Streptomyces venezuelae spores by increasing HupS affinity for DNA (2024)
Dorobek publikacyjny opiekuna naukowego pracowni w dziedzinie spektrometrii mas białek:
-
Structural Characterization of Cu(I)/Zn(II)-metallothionein-3 by Ion Mobility Mass Spectrometry and Top-Down Mass Spectrometry
-
Ion mobility mass spectrometry and molecular dynamics simulations unravel the conformational stability of zinc metallothionein-2 species
-
An Integrated Mass Spectrometry and Molecular Dynamics Simulations Approach Reveals the Spatial Organization Impact of Metal-Binding Sites on the Stability of Metal-Depleted Metallothionein-2 Species
-
Mass Spectrometry-Based Structural Analysis of Cysteine-Rich Metal-Binding Sites in Proteins with MetaOdysseus R Software
-
Metal- and Affinity-Specific Dual Labeling of Cysteine-Rich Proteins for Identification of Metal-Binding Sites
-
Crosstalk of the structural and zinc buffering properties of mammalian metallothionein-2
