DOKTORANCI

• Mgr Wojciech Wiertelak
• Mgr Edyta Skurska

Laboratorium Zakładu Biochemii i Pracowni Biologii Medycznej :

pokój 3.39;    tel.  71-375-2394

TEMATYKA BADAŃ

• Analiza struktury i funkcji części cukrowej glikoprotein
• Analiza mechanizmów glikozylacji komórkowej
• Badanie podstaw molekularnych chorób CDG

STOSOWANE TECHNIKI I METODY

• Techniki biologii molekularnej (izolacja i analiza DNA i RNA)
• Hodowle bakteryjne (Escherichia coli) i drożdżowe (Pichia pastoris)
• Hodowle komórek owadzich i ssaczych
• Nadprodukcja i oczyszczanie białek rekombinowanych
• Oczyszczanie białek (metody chromatograficzne, elektroforetyczne, chromatografia niskociśnieniowa, FPLC, HPLC)
• Mutageneza
• Techniki mikroskopii fluorescencyjnej i konfokalnej
• Analiza oddziaływania białko-białko (NanoBiT, FLIM-FRET, in situ PLA, koimmunoprecypitacja)
• Analiza struktur cukrowych
• Cytometria

TEMATY PRAC MAGISTERSKICH

1. Wyprowadzenie ludzkich linii komórkowych z nokautem oraz nadprodukcją genu kodującego transporter UDP-N-acetyloglukozoaminy i ich wstępna charakterystyka.
2. Analiza funkcji błonowego białka SLC35B4 w glikozylacji komórkowej.
3. Wykorzystanie systemu NanoBiT do badania kompleksów białkowych pośredniczących w glikozylacji makrocząsteczek.
4. Inaktywacja genu SLC35A2 w linii CHO i charakterystyka wyprowadzonych transfektantów.
5. Wyprowadzenie i wstępna charakterystyka sublinii HEK293T różniących się poziomem biosyntezy transportera UDP-galaktozy.

TEMATY PRAC DOKTORSKICH

1. Funkcjonalna charakterystyka białek błonowych z podrodziny SLC35A.
2. Funkcjonalna analiza potencjalnych transporterów UDP-N-acetyloglukozoaminy.
3. Poszukiwanie składu oraz biologicznego znaczenia kompleksów białkowych błony aparatu Golgiego uczestniczących w glikozylacji.
4. Badanie komórkowego modelu schorzenia typu CDG, spowodowanego mutacjami wybranych transporterów nukleotydo-cukrów.

WYPOSAŻENIE NAUKOWE

• Analityczne systemy HPLC (3 zestawy firmy Knauer, 1 zestaw Perkin Elmer 200)
• Analityczno-preparatywne systemy FPLC firmy Pharmacia (dwa zestawy)
• Spektrofotometry UV-Vis: HP (diodowy) i Beckman DU-640
• Chromatograf gazowy HP 5890
• Pracownia hodowli komórkowych (inkubator CO₂, stoły laminarne, komory do przechowywania próbek w ciekłym azocie)
• Aparatura do biologii molekularnej (wytrząsarki, cieplarki, termocyklery, zestawy do elektroforezy agarozowej i poliakrylamidowej 1D i 2D)
• System analizy obrazu GelDoc2000 (Bio-Rad)
• Ultrawirówka Optima LE-80K (Beckman)
• Wirówki analityczne i preparatywne
• Luminometr GlowMax Discover (Promega)

PROJEKTY BADAWCZE

• Projekt badawczy NCN OPUS nr 2019/35/B/NZ3/00481 „W poszukiwaniu dróg transportu UDP-N-acetyloglukozoaminy, jednego z głównych substratów glikozylacji w komórkach eukariotycznych”
  Kierownik projektu: prof. dr hab. Mariusz Olczak
• Projekt badawczy NCN OPUS nr 2016/21/B/NZ5/00144 „Molekularne podstawy terapii rzadkich chorób genetycznych wywołanych defektami transporterów nukleotydo-cukrów”
  Kierownik projektu: prof. dr hab. Mariusz Olczak
• Projekt badawczy NCN PRELUDIUM nr 2017/27/N/NZ3/00369 „Analiza współdziałania białek SLC35A3, SLC35B4 i SLC35D2 w dystrybucji UDP-N-acetyloglukozoaminy w komórkach ssaczych”
  Kierownik projektu: mgr inż. Bożena Szulc
• Projekt badawczy NCN SONATA nr 2016/23/D/NZ3/01314 „W poszukiwaniu nowych funkcji białka SLC35A2”
  Kierownik projektu: dr Dorota Maszczak-Seneczko

WYBRANE PUBLIKACJE